A Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Presidente Prudente foi criada a 17 de setembro de 1957 sendo inaugurada oficialmente a 3 de maio de 1959, na condição de Instituto Isolado de Ensino Superior. Assim como as outras faculdades, chamadas de Faculdades de Filosofia, a Faculdade de Presidente Prudente foi criada com o objetivo de atender à forte demanda da região por uma escola de nível superior e no atendimento à política do Estado visando à interiorização da cultura. Da mesma forma que as faculdades de Assis, Marília, Rio Claro e Rio Preto, na sua criação deveriam ser resguardados os critérios de qualidade do ensino e garantidas as condições de funcionamento de sua infra-estrutura. De início funcionaram os cursos de Geografia e Pedagogia. Em 1963 foi autorizado o funcionamento dos cursos de Matemática e Ciências Sociais. Com a criação da UNESP, em 1976, a Faculdade perdeu os cursos de Pedagogia, Ciências Sociais, Licenciatura em Ciências e Estudos Sociais ficando com a denominação de Instituto de Planejamento e Estudos Sociais (IPEA). A unidade de Presidente Prudente foi uma das mais atingidas pela reestruturação dos cursos, de conformidade com o Estatuto da UNESP, o que levou a uma transferência muito grande de docentes para outras unidades ou mesmo para outras universidades. Essas modificações não foram tranqüilas e ocorreram em meio a manifestações de protesto por parte da comunidade universitária. Em 1977, foi instalado o Curso de Engenharia Cartográfica e em 1984, foi criado do curso de Estatística. Em 1988, o IPEA incorporou o Instituto Municipal de Ensino Superior, com cursos de Fisioterapia e Educação Física e reimplantou o curso de Pedagogia. Em 1989, sua denominação foi alterada para Faculdade de Ciências e Tecnologia. A unidade desenvolve cursos de Educação Física, Engenharia Cartográfica, Estatística, Fisioterapia, Geografia, Matemática e Pedagogia, ministra cursos de especialização e pós-graduação. Sua atividade de extensão se dá nas mais diversas formas e em diferentes campos de atuação.